Vad menas med extraktion av dna

Här hittar ni praktiska övningar ifall "DNA-extraktion" samt "Att känna igen arter tillsammans med streckkoder". Plus kunskap samt råd angående PCR samt sekvensering.

1. DNA-extraktion

För för att göra begreppet ”DNA” mindre teoretisk förmå eleverna själva utvinna DNA inom märkbart struktur.

Här utgår ni från ett blandning från insekter samt andra substrat tillsammans högt DNA-innehåll, samt så utvinner ni DNA tillsammans några enkla köksredskap.

DNA är en stor och komplex molekyl som kallas för makromolekyl

Resultatet blir ett genomskinlig stäng från DNA vilket man förmå fingra på.

Celler är byggstenarna inom allt liv. Våra kroppar består från ca enstaka biljon celler. varenda fängelse äger en antal viktiga organeller, detta önskar säga cytoplasma, mitokondrier, plasmamembran samt cellkärna.

Kärnan är cellens inflytelserik centrum samt dess primära övning är för att lagra samt skydda DNA (deoxiribonukleinsyra) tillsammans med hjälp från olika proteiner samt lipidmembran.

DNA är detta ärftliga materialet inom nästan samtliga levande organismer samt innehåller dem instruktioner likt krävs för för att ett organism bör utvecklas, överleva samt reproducera.

detta första vilket vetenskapsman utför inom laboratorier tillsammans molekylärbiologi är för att extrahera DNA från cellerna dem studera – varenda tester, analyser samt nära behov sekvensering (läsning från DNA-kod) kommer efter detta. Nedan visar oss enstaka gör-det-själv teknik för för att extrahera DNA från levande plantor (vilken ätbar del alternativt grönsak ni vill) tillsammans med hushållsmaterial från köket.

DNA-extraktion

DNA-produkten är ej lika ren likt när man gör detta inom en labb, dock varenda steg är inom stort sett lika.

Material

• Färsk fruktbarhet blandad tillsammans insekter (frukten, t.ex. jordgubbar, behövs för för att detta bör finnas så många DNA för att man faktiskt är kapabel titta det)
• Plastpåse
• Liten sil
• Shot-glas
• Diskmedel
• Bordssalt
• Ananasjuice (valfritt)
• Kall, kraftfull etanol (helst 95 % dock 40 % fungerar också)
• Tandpetare
• Liten plasttub

Gör så här

1. Lägg frukten samt insekterna in ett plastpåse.

   Försegla påsen, låt den ligga ner inom frysen inom 30 minuter, sedan krossar ni frukten inom påsen. Detta förstör cellväggarna inom frukt- samt insektscellerna - den första barriären liksom skyddar DNA.

2. Filtrera den krossade frukten genom ett sil. Samla juicen inom en shotglas.
3. Tillsätt ~10ml medel för att diska, 5ml ananasjuice samt ett nypa krydda.

   Mixa försiktigt (försök undvika skumbildning). Här kommer diskmedlet ta grabb ifall detta skyddande lipidmembranet.

   DNA finns i cellkärnan i alla celler hos växter och djur (i bakterier finns det löst i cellplasman, eftersom de saknar cellkärna)

   Ananasjuicen besitter enzymer vilket förstör proteiner samt tar grabb angående proteinerna såsom omger DNA. krydda fäster sig mot DNA samt hjälper mot för att separera detta från lösningen.

4. Nu när DNA friats från kärnan flyter detta omkring inom lösningen. Lägg mot ca 2-3ml kall 95 % etanol, gärna tillsammans med ett kanyl längs kanten på shotglaset.
5. Ta ett titt på shotglaset.

   vad är detta ni ser inom toppen från vätskan? DNA löser sig ej inom alkohol samt blir därför synligt inom lagret mellan etanolen samt frukt-såpa mixen.

6. Du förmå för tillfället försiktigt fiska upp DNA tillsammans med tandpetaren samt placera inom den lilla tuben. Substansen är helt ofarlig så detta går utmärkt för att fingra samt känna på den.

   Häll på lite mer etanol inom tuben ifall detta behövs.

7. Grattis!
   DNA-molekylen har en förmåga att kunna dupliceras (göra en kopia av sig själv)

   för tillfället besitter ni utfört enstaka DNA-extraktion!

Andra förslag på upplägg från laborationen:

Extraktion från DNA ur egna kindceller

Extraktion från DNA ur vetegroddar

2. PCR - data samt resurser

De prover såsom oss samlat in innehåller ganska små mängder DNA. För för att få upp mängden mot ett nivå såsom oss förmå avläsa (sekvensera) måste oss först mångfaldiga mängden DNA.

Information ifall DNA-analys från Naturhistoriska riksmuseet

Principerna för PCR-tekniken 

Enkel animation från PCR teknik
Videon fungerar bäst angående ni tar försvunnen ljudet samt själv förklarar vilket liksom händer.

Illustrationer

3.

Sekvensering - kunskap samt resurser

Att sekvensera DNA är lättare än man tror. Idag är kapabel man köpa ett personlig apparat för att koppla mot enstaka vanlig bärbar datamaskin – för bara 20 000 kr. önskar man slå på stort samt producera miljarder sekvenser får man räkna tillsammans med tilläggsutgifter på ca 15 000 kronor.

För för att få väldiga mängder DNA-sekvenser från tusentals insekter kör dem flesta vetenskapsman ännu tillsammans med dyrare utrustning.

För för att förklara hur man gör tillsammans med olika tekniker att föreslå eller råda något oss följande länkar:

4.

för att känna igen arter tillsammans streckkoder 

När man väl fått fram sina DNA-sekvenser identifierar man dem genom för att jämföra dem tillsammans med så kallade referensbibliotek. detta största heter modig (där finns också några fler nyttiga undervisningsresurser). inom den här rutan är kapabel ni fästa in enstaka okänd sekvens samt titta vilken art den kommer från.

Om ni önskar testa för att detta fungerar förmå ni söka efter ett sekvens från någon art likt intresserar dig. 

Kopiera sekvensen från den individ vilket ni valt samt fästa in den inom rutan ovan.

Tryck ”submit” samt titta vilken art din sekvens passar bäst. Matchar sekvensen den art vilket den identifierats likt alternativt äger någon satt fel namn på den?

Praktisk övning

För för att förstå vilket datorn gjorde för dig är kapabel ni idag göra identisk sak tillsammans med ögonmått.

Här får ni ämne för att nedteckna ut - så stort liksom skolan besitter möjlighet till.

Häng upp ditt referensbibliotek på väggen, samt ge eleverna inom arbetsuppgift för att jämföra sina okända sekvenser tillsammans dem på väggen. När dem hittar ett matchande sekvens bör dem nedteckna ner numret på sekvensen samt bokstaven på arten.

Rätt svar finns för att tillgå inom en facit. detta här är exakt detsamma liksom forskarna gör för miljontals sekvenser, dock då använder oss förstås datorer. Poängtera för eleverna at dem gjort noggrann detsamma liksom datorn på baksidan BOLD!

Sekvenser vilket eleverna bör ha

DNA-sekvenser sektion 1

DNA-sekvenser sektion 2

Referensbibliotek över DNA-sekvenser likt bör sitta på väggen

Referensbibliotek för att sätta upp på väggen

Allra roligast blir detta ifall ni vilket lärare hinner bekanta dig lite tillsammans insekterna på baksidan streckkoderna.

Extraktion av DNA

Då förmå ni berätta lite ifall vilka arter just den-och-den eleven äger hittat. 

Som butikens streckkoder

DNA-baserad identifiering från arter är ett teknik liksom slagit igenom beneath dem senaste 20 åren. DNA-sekvensen är kapabel tecknas vilket ett ord tillsammans med bokstäverna A, C, T, samt G inom olika kombinationer.

Den ord såsom man avläser kunna man sedan jämföra tillsammans med samtliga kända sekvenser inom referensbiblioteket.

Principen är noggrann densamma liksom när man avläser enstaka streckkod på enstaka artikel inom butiken för för att fastställa vad den är (och vad den kostar). Därför kallas tekniken DNA-streckkodning.

Hos insekter samt andra varelse använder man främst den mitokondriella genen cytokrom c oxidas subenhet inom (COI).

Den genen uppvisar mera variation mellan än inom arter, vilket behövs för för att sekvensen skall behärska föras mot ett bestämd art.

Vill ni gå vidare till:

1. Insekternas mångfald

2. Hur samlar man insekter? samt 3.

För att göra begreppet ”DNA” mindre abstrakt kan eleverna själva utvinna DNA i synlig form

Titta på samt sortera insekter

4. Hur fungerar DNA-metoder?

5. för att döda insekter - etik